Teilprojekt eines Verbundes

Biomarker Analysen

Förderkennzeichen: 01ZX1903B
Fördersumme: 295.637 EUR
Förderzeitraum: 2019 - 2022
Projektleitung: Prof. Dr. Olaf Wolkenhauer
Adresse: Universität Rostock, Fakultät für Informatik und Elektrotechnik, Institut für Informatik, Lehrstuhl für Systembiologie und Bioinformatik
Ulmenstr. 69
18057 Rostock

Mit dem Älterwerden kommt es zur Zellalterung und zu Mehrfacherkrankungen. Zelluläre Seneszenz ist ein wesentlicher Treiber eines Netzwerks von Krankheiten, einschließlich Krebs und Schlaganfall. In dem Projekt SASKit werden Systemmodellierung und Bioinformatik genutzt, um aus molekularen Daten und anderen Labordaten ein Biomarker + Software-Werkzeug zu entwickeln, dessen Schwerpunkt auf der Messung und Interpretation von seneszenzabhängigen Signaturen liegt, für eine präzise (und frühzeitige) Diagnose, Prognose und letztendlich Therapie von Bauchspeicheldrüsenkrebs und ischämischem Schlaganfall / Thromboembolie. Die Basis sind Veröffentlichungen, in denen beschrieben wird, wie die zelluläre Seneszenz und die mit der Seneszenz assoziierte Sekretion inflammatorischer Substanzen direkt an der Komorbidität von Bauchspeicheldrüsenkrebs, ischämischem Schlaganfall und allgemeiner an Krebs- und Gerinnungsproblemen beteiligt sind. Aus Omics- und anderen Labordaten soll ein Biomarker + Software-Kit entwickelt werden, dessen Schwerpunkt auf der Messung und Interpretation von seneszenzabhängigen Signaturen liegt, für eine präzise (und frühzeitige) Diagnose, Prognose und letztendlich Therapie von Bauchspeicheldrüsenkrebs und ischämischem Schlaganfall / Thromboembolie. Das Vorhaben erforscht systemisch-molekulare Zusammenhänge zwischen zwei verschiedenen gesundheitsökonomisch bedeutsamen Krankheitsbildern, um gemeinsame Krankheitsmechanismen und Signalwege zu identifizieren und zu beschreiben. Dazu wird insbesondere Komorbidität betrachtet. Die Bioinformatik dient der Suche nach den optimalen Biomarkern durch maschinelles Lernen.