Einzelprojekt

OCEAN - Optische Kohärenzelastographie und künstliche Intelligenz in der Neuropathologie für eine effizientere histologische Analyse von Hirngewebe

Förderkennzeichen: 01KD2424
Fördersumme: 49.002 EUR
Förderzeitraum: 2024 - 2025
Projektleitung: Dr. Ralf Brinkmann
Adresse: Universität zu Lübeck, Sektion Naturwissenschaften, Institut für Biomedizinische Optik
Peter-Monnik-Weg 4
23562 Lübeck

Mit dem diesem Vorhaben sollen die mechanischen Eigenschaften verschiedener Hirngewebetypen (weiße Substanz, graue Substanz, Tumor, Ödem etc.) quantifiziert werden, um Chirurginnen und Chirurgen zukünftig bei der Identifizierung unterschiedlicher Gewebetypen während der Operation zu unterstützen. Die Grundlage für die mechanische Charakterisierung der verschiedenen Gewebetypen bilden zwei Datensätze, die in früheren Projekten erworben wurden. Der erste Datensatz besteht aus 4.000 Hämatoxylin-Eosin (HE)-Schnitten, die von einem Neuropathologen annotiert wurden. Die Annotationen bestehen aus pixelgenauen Labels von 14 verschiedenen Gewebetypen, darunter drei verschiedene Stadien der Tumorinfiltration. Der zweite Datensatz umfasst 100 HE-Schnitte mit den entsprechenden mechanischen Eigenschaften. Diese HE-Schnitte sind nicht annotiert. Die mechanischen Eigenschaften wurden mittels optischer Kohärenz-Elastographie (OCE) bestimmt. OCE ist eine Bildgebungsmethode, die auf der optischen Kohärenztomographie basiert, einer laserbasierten Bildgebungstechnik zur Erstellung tomographischer Bilder.