Ein wesentlicher Aspekt der pathogenen zellulären Funktionen ist die Deregulation des Epigenoms der Zelle und die damit verbundenen Veränderungen im Transkriptom. Dementsprechend liefern genomweite Karten von epigenetischen Signalen und Genexpressionsprofile aus hochauflösenden Sequenzierungen reichlich Informationen über den Krankheitszustand. Zusätzlich können in der Klinik Wirkstoffe, die Chromatin-modifizierende Enzyme oder Proteine, die epigenetische Signale "lesen", inhibieren, gezielt auf deregulierte epigenetische Signalwege gerichtet werden. Trotz des breiten Spektrums an leistungsfähigen Anwendungen bleibt die funktionale epigenomische Analyse in der Systemmedizin eine anspruchsvolle Aufgabe. Sie bedarf eines Konzepts zur Aquisition experimenteller "multi-readout"-Daten aus einer begrenzten Menge an Patientenprobenmaterial sowie die anschließende Analyse und Integration der Daten. Diese Aufgaben werden in der SEEDED Summer School adressiert werden, um Doktoranden und Postdoktoranden in der Analyse epigenetischer Deregulation mit komplementären "multi-readout"-Datensätzen auszubilden.