Ein zentraler Aspekt der INTIMIC-Wissensplattform ist die Standardisierung und Harmonisierung von Mikrobiom-Analysen, die eine zentrale Bedeutung für die Vergleichbarkeit von klinischen Studien und der wissenschaftlicher Grundlagenforschung darstellt. Der erfolgreiche Transfer von Erkenntnissen der Grundlagenforschung zur medizinisch-therapeutsichen Anwendung im Bereich der Mikrobiom-Forschung wird durch äußere Einflussfaktoren (z. B. Ernährung, Medikation) aber auch methodisch versursachten Veränderungen während der Mikrobiom-Analytik erschwert. Die möglichst exakte Kenntnis und Überprüfbarkeit dieser Einflussfaktoren ist deshalb ebenso wie die präzise Erfassung von multi-integrativen Daten Voraussetzung zur Durchführung einer standardisierten Analyse. Ziel des Arbeitspakets AP2 ist deshalb die Erarbeitung von Richtlinien zur Mikrobiom-Analytik, die sich insbesondere aus der systematischen Erfassung der von den Mitgliedern der Wissensplatform etablierten Protokolle und Standardverfahrensanweisungen (SOPs) zur Mikrobiom-Analytik ableiten lassen. Die gesammelten SOPs werden den Mitgliedern kommentiert zur Verfügung gestellt. In Zusammenarbeit mit den AP-Mitgliedern wird daraus ein Konzept zur Durchführung von internationalen Laborvergleichen erarbeitet um die relevanten methodischen Aspekte möglichst exakt zu erfassen. Ebenso werden Methoden zur Integration von multi-omics Datensätzen mit methodischen und medizinischen Metadaten evaluiert. Die INTIMIC-KP ist eine Maßnahme der JPI-HDHL ("a healthy diet for a healthy life"). An der europäischen Plattform sind 52 Partner aus 9 Ländern beteiligt.