Das Einzelprojekt CLARITY beschäftigt sich mit dem Thema Populationsgenetik am Beispiel der Züchtung von Milchkühen. In der Tierzucht spielt das detaillierte Verständnis der komplexen Zusammenhänge bei der Rekombinationsrate sowie der exakten genetischen Verortung von Eigenschaften auf dem Chromosom eine entscheidende Rolle. Für die gezielte Vererbung von Eigenschaften ist es wichtig, sowohl den physischen Abstand (gemessen in Zentimetern) als auch den genetischen Abstand (gemessen in Basenpaaren) zwischen den einzelnen molekularen Markern genau zu kennen. Diese Werte unterscheiden sich bei jedem Tier und werden daher in Genomdatenbanken gesammelt. Die Datenbanken müssen regelmäßig auf den neusten Stand gebracht und mit einem aktuellen Index versehen werden, was sehr zeitaufwändig und rechenintensiv ist. Im Rahmen des Projekts soll dieser Prozess beschleunigt und erleichtert werden.

Es ist geplant, geeignete Analysewerkzeuge zu entwickeln bzw. zu verbessern und mit ihrer Hilfe am Beispiel einer deutschen Milchrindrasse eine Übersichtskarte der verschiedenen molekularen Markerabstände zu entwickeln. Dafür sollen umfangreiche Genotypdaten detailliert analysiert sowie ein bereits vorhandenes statistisches Modell weiter verfeinert werden. Die Analyseergebnisse werden anschließend in einer Datenbank veröffentlicht, die im Rahmen von Open Access allen Forscherinnen und Forschern zur Verfügung steht.

Die Datenbank wird offen für Erweiterungen um andere Rinderrassen sein und den Vergleich mit weiteren Spezies erlauben. Die im Rahmen des Projekts entwickelten Analysewerkzeuge werden sich zudem gut auf weitere Anwendungsfelder übertragen lassen.