Das Einzelprojekt SABIO-VIS beschäftigt sich mit der SABIO-RK-Datenbank, die biochemische Reaktionen und deren kinetische Parameter aus der Literatur speichert. In der Datenbank wurden in den letzten zehn Jahren über 230.000 kinetische Parameter in unterschiedlicher Qualität hinterlegt. Sowohl quantitativ als auch qualitativ hat die SABIO-RK-Datenbank damit nun ein Level erreicht, bei dem es sich lohnt, neue Datenanalyse-Werkzeuge zu entwickeln und zu nutzen. Konkret sollen im Rahmen des Projekts SABIO-VIS verschiedene Visualisierungsmethoden entwickelt werden, mit denen künftig gezielt die kinetischen Daten untersucht, validiert und in ihrer Qualität kontrolliert werden können.

Der Schwerpunkt der Methodenentwicklung liegt dabei auf den Anforderungen von Modelliererinnen und Modellierern, die die Hauptnutzergruppe der SABIO-RK-Datenbank darstellen. Für diese sollen verlässliche Visualisierungsmethoden entwickelt werden, die sie bei der Suche nach nützlichen Daten für eine Modellentwicklung unterstützen, ohne dabei die Korrektheit der einzelnen Daten erneut überprüfen zu müssen. Es ist geplant, eine Visualisierung der kinetischen Parameter zu ermöglichen, die nach bestimmten nutzerabhängigen Suchkriterien erfolgt. Auch mögliche Abweichungen oder Ungenauigkeiten der kinetischen Parameter sollen künftig bildlich hervorgehoben bzw. quantifiziert werden können. Es ist zudem vorgesehen, Methoden zur Analyse und zur Zusammenfassung der Daten aufgrund gemeinsamer Kriterien wie beispielsweise experimentelle Bedingungen zu entwickeln.

Die Ergebnisse des Projektes werden die Nutzbarkeit der SABIO-RK-Datenbank stark verbessern. Mit den neuen Möglichkeiten lassen sich größere Datensätze analysieren und neue Zusammenhänge darstellen, so dass sich zahlreiche neue Einblicke und Erkenntnisse aus den vorhandenen Daten gewinnen lassen werden.