Einzelprojekt

RTK-Struktur - Struktur und Funktion der Nichtstrukturproteine in SARS-CoV-2 Replikations- und Transkriptionskomplexen

Förderkennzeichen: 01KI20391
Fördersumme: 50.000 EUR
Förderzeitraum: 2020 - 2021
Projektleitung: Dr. Charlotte Uetrecht
Adresse: Heinrich-Pette-Institut, Leibniz-Institut für Experimentelle Virologie, Forschungseinheiten - Nachwuchsgruppen, Dynamik viraler Strukturen
Martinistr. 52
20251 Hamburg

Gesamtziel des Vorhabens ist die Übertragung der Arbeiten zu SARS-CoV Nichtstrukturproteinen (NSP) auf SARS-CoV-2. Hierzu sollen insbesondere alle nicht membrangebundenen NSP sowohl in Bakterien als auch eukaryotischen Systemen exprimiert werden. Anschließend sollen Teilkomplexe der Replikations- und Transkriptionskomplexe (RTK) aus den aufgereinigten NSP assembliert und auf ihre Funktionalität, z. B. RNA Bindung und Prozessierung, untersucht werden. Ausgewählte Komplexe sollen nach der Charakterisierung mit nativer Massenspektrometrie (MS) funktionalen Assays und strukturbiologischen Methoden mit höherer Auflösung zugeführt werden, um ein besseres Verständnis der Virusbiologie zu erhalten. Die Arbeiten erfolgen im Rahmen von Modul 4 – Unterstützung bereits laufender Forschungsprojekte zu Coronaviren – und erweitert den ERC Starting Grant ERC-StG-2017 759661 "SPOCk’S MS - Sampling Protein cOmplex Conformational Space with native top down Mass Spectrometry”. Die Ziele gestalten sich wie folgt: 1) Expression der SARS-CoV-2 NSPs; 2) Assemblierung von Proteinkomplexen der RTKs und 3) Strukturelle und funktionelle Untersuchung der erhaltenen Komplexe.