Teilprojekt eines Verbundes

Standort Heidelberg EMBL

Förderkennzeichen: 01KU1505F
Fördersumme: 111.370 EUR
Förderzeitraum: 2015 - 2017
Projektleitung: Dr. Jan Korbel
Adresse: Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie (EMBL), Genome Biology Unit
Meyerhofstr. 1
69117 Heidelberg

Das Vorhaben am EMBL bearbeitet das Arbeitspaket 2 (AP2) im TP2. In dem Vorhaben werden bioinformatische Analysen speziell im Hinblick auf die Analyse der Strukturvariations-Daten auf Grundlage der bereits generierten Daten durchgeführt. Diese Analyse struktureller Aberrationen (wie z. B. Deletionen oder Translokationen) ist für die Erforschung nicht-kodierender Regionen des Erbguts von zentraler Bedeutung, da sie einen entscheidenden Einfluss auf die Aktivierung von Onkogenen und Tumorentstehung haben können. Ziel ist es, frühere und wesentlich präzisere Prognosen bei Prostatakarzinomen aufzuzeigen. Im Vordergrund von AP2 des Teilprojektes 2 steht die tiefergreifende bioinformatische Analyse der vorhandenen Ganzgenomdatensätze mit der Weiterentwicklung der Analysetools und bioinformatischen Pipelines. Diese Daten sollen mittels modernster Methoden zur Strukturvariations-Analyse mit den Genomdaten von älteren Prostatakrebspatienten verglichen werden.