Förderkennzeichen: | 01KU1505C |
Fördersumme: | 138.685 EUR |
Förderzeitraum: | 2016 - 2018 |
Projektleitung: | Dr. Dr. Steve Hoffmann |
Adresse: |
Universität Leipzig, Interdisziplinäres Zentrum für Bioinformatik (IZBI) Härtelstr. 16-18 04107 Leipzig |
Im Teilprojekt 1 (TP1) werden pathogenetische Mechanismen bei Lympphomerkrankungen identifiziert und charakterisiert. Auch sollen neue Marker für klinisch relevante Subgruppen dieser Lymphome identifiziert werden, und schließlich sollen neue Ansatzpunkte für die Therapie gefunden werden. Im Vorhaben der Uni Leipzig (Arbeitspakete AP5b und AP6b) werden speziell die Transkriptom- und Epigenomdaten weiter bioinformatisch analysiert. Der Standort Leipzig übernimmt die bioinformatischen Auswertungen für Transkriptom und Epigenom in TP1 in Zusammenarbeit mit Ulm. Dazu gehört die Evaluation differentiellen Splicings zwischen Lymphomen und Kontrollen. Es werden Methoden entwickelt, um epigenetische Daten (DNA-Methylierung/Histonmodifikationen) zu integrieren und Auswirkungen auf die Expression adjazenter/distanter Gene und Netzwerke zu untersuchen. Ferner werden die Daten bioinformatisch nach differentiell exprimierten nicht-kodierenden RNAs und deren Auswirkungen auf das Epigenom untersucht.