Teilprojekt 4 beschäftigt sich mit der Detektion von mit Krebs assoziierten Infektionserregern. Ca. 18-20% aller Tumorerkrankungen werden durch solche Infektionserreger hervorgerufen. Daher hat es das hier beschriebene Projekt zum Ziel, Standards für die umfassende und hypothesenfreie Detektion und Analyse von Infektionserregern in Sequenz-Datensätzen aus Tumorproben zu entwickeln.   Das geplante Vorhaben wird integrierte und optimierte bioinformatische Lösungen entwickeln und validieren, welche zur zuverlässigen Identifikation von bekannten wie auch putativ neuen Infektionserregern in aus Tumormaterial stammenden Sequenz-Daten geeignet ist. Das Verfahren beruht auf der de-novo Assemblierung primärer DNA oder RNA Sequenzdaten. Diese werden einer taxonomischen Klassifizierung durch Homologiesuche und Mustererkennung, sowie der Erfassung weiterer Parameter mit möglicherweise klinischer Relevanz (z. B. chromosomaler Integrationsstellen) zugeführt. Die entwickelten Methoden werden zur Untersuchung von Tumor-Datensätzen eingesetzt. Neben der Validierung der entwickelten Standards werden von diesen Studien auch wichtige Erkenntnisse hinsichtlich der Rolle von Infektionserregern bei der Krebsentstehung erwartet.