Seit 2009 wird die Nationale Forschungsplattform für Zoonosen vom BMBF mit dem Ziel gefördert, Zoonosenforscherinnen und -forscher der verschiedenen Fachdisziplinen (Humanmedizin, Veterinärmedizin, Infektionsbiologie etc.) in Deutschland und international zu vernetzen, um exzellente Forschungsarbeit in diesem Bereich zu unterstützen. Inzwischen (Stand Juni 2018) vereint die Zoonosenplattform mehr als 800 Mitglieder unter ihrem Dach, die das Angebot interdisziplinärer Veranstaltungen (auch unter Beteiligung des Öffentlichen Gesundheitswesens) sowie die Förderberatungen über mögliche Antragstellungen vor allem im Bereich der Förderung von Pilot- und Querschnittsprojekten oder die Nachwuchsangebote intensiv nutzen. Die Aufgaben der Geschäftsstelle werden an zwei Standorten umgesetzt, zum einen am Friedrich-Loeffler-Institut auf der Insel Riems (FLI), zum anderen an der Universität Münster. Schwerpunkt der Aktivitäten des Geschäftsstellenstandortes FLI ist das Arbeitspaket der Förderung der Nachwuchswissenschaftlerinnen und Nachwuchswissenschaftler.