Das Projekt besteht aus den folgenden zwei Forschungsschwerpunkten: 1) Zusammenstellung und Genomsequenzierung einer repräsentativen Stammsammlung von kommensalen und pathogenen E.coli aus verschiedenen Wirten, sowohl animale, wie auch humane und aus verschiedenen geographischen Regionen. Diese Primärdaten zu den Stämmen werden zusammen mit den Genomsequenzen in einem zentralen DataWarehouse für das Konsortium zusammengeführt. 2) Umfassende bioinformatische Analyse der Genomsequenzen zur Identifizierung genomischer Elemente, die mit Wirtsspezifität assoziiert sind. Hierzu wird sowohl das Core-Genom, als auch das Accessory-Genom analysiert. Ebenfalls erfolgt die Charakterisierung der Resistenz-tragenden Plasmide.