Teilprojekt eines Verbundes

Anteil Institut für Molekulare Biologie Mainz, Teilprojekte SP1, SP3, SP4, SP5 und SP6: Modellierung von Telomer-Erhaltungs-Mechanismus- (TMM) Netzwerken in Tumoren

Förderkennzeichen: 01ZX1302E
Fördersumme: 173.887 EUR
Förderzeitraum: 2015 - 2017
Projektleitung: Dr. Brian Luke
Adresse: Institut für Molekulare Biologie gGmbH
Ackermannweg 4
55128 Mainz

In diesem Vorhaben sollen nicht-kodierende TERRA-RNAs, die die TMM-Aktivität beeinflussen, bewertet werden. Daraus entwickelt sich ein TMM-Klassifizierungsschema, das die Expression von TERRA vorhersagt und mittels TERRA qRT-PCR validiert. Die Quantifizierungs-Methode wird optimiert, um damit eine zuverlässige Detektion der TERRA-Expression an mehreren Telomeren und letztlich in einem einstufigen Verfahren zu ermöglichen, das für die klinische Anwendung angepasst werden kann. Die Ergebnisse werden für eine funktionelle Analyse von TERRA in Bezug auf TMMs verwendet. TRAP-Methoden und/oder direkte Telomerase Aktivitäts-Messmethoden (Telo-Spot) werden angewandt, um eine mögliche Telomerase-Aktivität in Tumorproben zu untersuchen. C-circle Assays und PCR-basierte Techniken zur quantitativen Detektion von telomerischen Sequenzvarianten werden zur genaueren Abgrenzung der TMM-Untergruppen eingesetzt. Die Funktion von TMM-Kandidatengenen, die basierend auf dem Modell vorhergesagt wurden, wird in Hefe-Deletionsstämmen untersucht.