Am DKFZ werden in vier Teilprojekten (TP) die Entstehung und Progression von Neuroblastomen (NB) mit dem Ziel untersucht, die Risikostratifizierung (RS) von Patienten zu optimieren, Ergebnisse in die therapeutische Anwendung zu überführen und die Lebenserwartung von NB-Patienten zu verbessern. In TP A1 werden die Ergebnisse der Transkriptom-Sequenzierungsdaten aus der ersten Förderperiode (v. a. die synergistischen Interaktionen von MYCN und BRD9) analysiert und an einer zweiten Kohorte von Hochrisiko-Patienten validiert. In TP A3 wird anhand von Proteom-Analysen die variable Protein-Expression von primären NB untersucht, um Protein-Signaturen zu definieren und so die bisherige klinische und genomomische NB-Klassifizierung und RS zu verbessern. In TP B1 werden die statischen und zeitlichen Landschaften von Chromatin und Transkriptionsfaktorbindung von NB-Phänotypen untersucht, die charakteristisch für individuelle klinische und biologische NB-Subtypen sind. Außerdem soll die epigenetische Kontrolle der transkriptionellen Aktivität von MYC/MYCN zusammen mit Histon-Modifikationen und der Genexpression in NB entschlüsselt werden. In B4 werden Zielgene von microRNAs identifiziert, die im NB dereguliert sind und experimentelle Daten bioinformatisch analysiert. Aufbauend auf den Arbeiten zu genregulatorischen Netzwerken im MYCN-amplifizierten NB wird die Auswirkung dieser microRNAs auf Netzwerkfunktionen rechnerisch analysiert um molekulare Angriffspunkte für neue Therapieansätze zu finden.